g.GENLAB
Birlikte çalışalım ↗
MOLEKÜLER BİYOLOJİ & GENETİK

Yaşamın kodunu
anlamak, geleceği
yeniden düşünmek.

Hücrelerin ve genlerin anlattığı hikâyeleri araştırıyoruz. Her keşif, daha iyi sorular sormak için yeni bir başlangıç.

Araştırmalarımızı keşfet ↗Laboratuvarımız hakkında ↗
MERAKTAN KEŞFE, BİLİMDEN YAŞAMA
FIG. 01MOLECULAR FORM
GENETIC MATERIAL MOLEKÜLER BİYOLOJİ
01 / 04
BİLİMİN YENİ OLASILIKLARI
ÖNE ÇIKAN ÇALIŞMALARGÜNCEL ARAŞTIRMALAR

Laboratuvarımızdan son bulgular

Tüm çalışmaları gör ↗
BİYOMOLEKÜLER YAPIİNTERAKTİF GÖRÜNTÜLEYİCİ
Döndürmek için sürükleyin · Yakınlaştırmak için tekerleği kullanın

B-DNA Çift Sarmalı

Standart Watson-Crick B-form çift sarmal yapısı; genetik bilginin hücresel depolanmasını sağlayan temel nükleik asit organizasyonu.

FORMB-DNA
ÇAP~2.0 nm
EKSENSağ El Sarmal
BİYOİNFORMATİK ARAÇLARDİZİ VE GC ANALİZİ

DNA / RNA Nükleotid Analizörü

Herhangi bir nükleotid dizisi girin, FASTA (.fasta) dosyası yükleyin veya doğrudan NCBI veritabanından gen sekansı çekin; uzunluk, GC/AT oranı, ters tamamlayıcı ve transkripsiyonu anında hesaplayın.

Dizi Uzunluğu 0 bp
GC İçeriği %0.0
AT İçeriği %0.0
Tahmini Tm (°C) 0 °C
Ters Tamamlayıcı (Reverse Complement 5'→3'): -
mRNA Transkripti (5'→3'): -
Öngörülen Protein / Amino Asit Dizisi (Peptit Translasyonu): -

İnteraktif Genetik Kod / Kodon Tablosu Arayıcı

İki Nükleotid Dizisini Karşılaştır (Lokal/Global Hizalama)

PCR Primer Tasarımcısı & Termodinamik Tm Hesaplayıcı

Girilen hedef gen dizisi için 18-22 bp uzunluğunda optimal Forward ve Reverse PCR primer çiftlerini tasarlar.

PCR Termal Döngü Simülatörü (3 Aşamalı Amplifikasyon)

95°C Denatürasyon

DNA çift zinciri ayrılır (30 sn)

55°C Bağlanma (Annealing)

Primerler şablona bağlanır (30 sn)

72°C Uzama (Extension)

Taq Polimeraz sentezi (1 dk/kb)

Mevcut Durum: Beklemede Teorik Kopya Sayısı: 1 kopya (2⁰)
qPCR Erime Eğrisi (Dissociation Curve - -dF/dT) Analizi

SYBR Green tabanlı gerçek zamanlı PCR amplikonunun özgüllüğü, primer dimer varlığı ve erime tepe noktası (Tm Peak) profilini simüle eder.

Amplikon Tepe Tm: 84.5°C (Spesifik Tek Pik) Primer Dimer: Saptanmadı (Temiz)

Sanger Dizileme Elektroferogram / Kromatogram Görselleştiricisi

Kapiler elektroforez ve floresan ddNTP tabanlı 4 renkli Sanger dizileme pik profili (A=Yeşil, C=Mavi, G=Siyah, T=Kırmızı) ve kalite (Phred Q) skorları.

● A (Adenin - Yeşil) ● C (Sitozin - Mavi) ● G (Guanin - Siyah) ● T (Timin - Kırmızı)

Restriksiyon Enzimi Kesim Haritası & Sanal Agaroz Jel Simülatörü

Seçilen restriksiyon endonükleazları (EcoRI, BamHI, HindIII vb.) ile DNA dizinizi sanal olarak kesin ve elektroforez jel bantlarını canlı simüle edin.

Restriksiyon Enzim Kataloğu & Klonlama Stratejisi Sihirbazı (Cloning Planner)

Yönlü moleküler klonlama için 5' ve 3' restriksiyon enzim çiftlerini seçin; kesim uçları (Yapışkan / Küt), ısıl inaktivasyon ve çift kesim (Double Digest) tampon uyumunu anında denetleyin.

Dairesel Plazmit DNA Haritası (Plasmid Map Generator)

Laboratuvarda yaygın kullanılan genetik klonlama vektörlerinin promotor, direnç geni (AmpR/KanR), MCS ve replikasyon orijinlerini (Ori) dairesel harita üzerinde interaktif görüntüleyin.

Özellik Seçin

Plazmit halkası üzerindeki renkli gen bölgelerine tıklayarak veya üzerine gelerek konum ve işlev detaylarını inceleyebilirsiniz.

Vektör Boyutu: 2,686 bp
Seçim İşaretçisi: Ampisilin (AmpR)

CRISPR-Cas9 sgRNA Hedef Arayıcı (PAM: NGG Tarayıcı)

Hedef genomik DNA dizisindeki SpCas9 PAM dizilerini (5'-NGG-3') tarar ve 20 nükleotidlik potansiyel kılavuz RNA (sgRNA) hedeflerini listeler.

Laboratuvar Çözelti & Molarite Hesaplayıcı (Solution Calculator)

İstenen derişim (M, mM, µM) ve hacim (L, mL) için tartılması gereken kimyasal madde kütlesini (g, mg) formülle (m = M × V × Mw) hesaplar.

Oligo / Primer Seyreltme & Yeniden Süspansiyon (C₁V₁ = C₂V₂)

Liyofilize oligoları 100 µM stok konsantrasyona getirmek veya stoktan 10 µM çalışma çözeltisi hazırlamak için eklenecek TE tamponu veya nükleazsız su miktarını hesaplar.

Genetik Varyant & Allel Frekansı Hesaplayıcı (NGS / Sanger VAF)

Yeni nesil dizileme (NGS) veya dijital PCR okumalarında referans ve mutant okuma sayılarına göre Varyant Allel Frekansı (VAF %) ve zigosite durumunu (Heterozigot / Homozigot) hesaplar.

Genomik CpG Adaları & GC Kayması (GC Skew) Analizörü

Genomik promotör ve transkripsiyon başlangıç bölgelerini saptamak için Gardiner-Frommer kriterleriyle (Obs/Exp > 0.6, GC > 50%) CpG adalarını ve replikasyon yönü GC kaymasını ((G-C)/(G+C)) haritalar.

ARAŞTIRMA FELSEFESİDEĞERLERİMİZ
⌬

Merakla Sor

Hücrelerin moleküler mekanizmalarını derinlemesine inceleyerek çözülmemiş biyolojik sırları keşfediyoruz.

⟲

Birlikte Araştır

Disiplinler arası yaklaşımla genetik, biyokimya ve veri bilimini birleştiriyoruz.

✳

Bilgiyi Paylaş

Açık bilim prensipleriyle tüm bulgularımızı insanlığın ve akademik dünyanın yararına sunuyoruz.